Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IKBKBO14920 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms