Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CUX2O14529 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CUX2O14529 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CUX2O14529 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CUX2O14529 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CUX2O14529 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CUX2O14529 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CUX2O14529 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CUX2O14529 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CUX2O14529 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CUX2O14529 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CUX2O14529 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUX2O14529 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CUX2O14529 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CUX2O14529 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CUX2O14529 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CUX2O14529 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CUX2O14529 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CUX2O14529 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CUX2O14529 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CUX2O14529 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CUX2O14529 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CUX2O14529 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CUX2O14529 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CUX2O14529 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CUX2O14529 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CUX2O14529 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 764.7 ms