Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms