Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
POLRMTO00411 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms