Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms