Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLDN25C9JDP6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms