Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms