Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
B4DXG7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
B4DXG7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
B4DXG7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
B4DXG7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
B4DXG7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms