Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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