Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC69A6NI79 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms