Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms