Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP17L4A6NCW7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms