Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF22A3QJZ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms