Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC162PA2VCL2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC162PA2VCL2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms