Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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