Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.846e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 AGRN-208ENST00000479707 584 ntTSL 320.26■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-209ENST00000579698 572 ntTSL 420.01■□□□□ 0.799e-8■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.76e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PLXDC1-215ENST00000579190 565 ntTSL 417.7■□□□□ 0.425e-12■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-210ENST00000581271 528 ntTSL 417.6■□□□□ 0.419e-8■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-206ENST00000577624 510 ntTSL 317.57■□□□□ 0.49e-8■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 316.97■□□□□ 0.316e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.034e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 514.22□□□□□ -0.136e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-208ENST00000579366 681 ntTSL 311.78□□□□□ -0.529e-8■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 211.76□□□□□ -0.536e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.756e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 29.52□□□□□ -0.896e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 TIMP1-203ENST00000441738 341 ntTSL 58.84□□□□□ -0.994e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-206ENST00000482860 2599 ntTSL 26.31□□□□□ -1.44e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.78□□□□□ -1.483e-16■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)2.16□□□□□ -2.066e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC10.37□□□□□ -0.754e-19■□□□□ 9.5
UTP3Q9NQZ2 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.484e-19■□□□□ 9.5
UTP3Q9NQZ2 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 44.86□□□□□ -1.634e-19■□□□□ 9.5
UTP3Q9NQZ2 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.684e-19■□□□□ 9.5
UTP3Q9NQZ2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-11■□□□□ 9.4
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP426-201ENST00000362901 121 ntBASIC8.76□□□□□ -1.012e-11■□□□□ 9.4
UTP3Q9NQZ2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.01■□□□□ 0.631e-11■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 NDUFV2-208ENST00000577703 854 ntTSL 323.8■■□□□ 1.45e-7■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 NDUFV2-209ENST00000583375 211 ntTSL 517.34■□□□□ 0.375e-7■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 216.86■□□□□ 0.291e-17■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.11e-17■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2BG-201ENST00000541790 1534 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-8■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.474e-7■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM165-205ENST00000508404 1657 ntTSL 223.3■■□□□ 1.324e-7■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.314e-7■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM165-209ENST00000514070 433 ntTSL 218.19■□□□□ 0.54e-7■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-211ENST00000498516 655 ntTSL 322.93■■□□□ 1.261e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.191e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.081e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.921e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.531e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -04e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-209ENST00000472057 727 ntTSL 314.88□□□□□ -0.034e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-204ENST00000405198 3838 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.464e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.474e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.474e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.684e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-211ENST00000506298 549 ntTSL 27.78□□□□□ -1.165e-6■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 DDX5-225ENST00000583562 465 ntTSL 1 (best)6.81□□□□□ -1.325e-6■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 RPL36-208ENST00000590786 907 ntTSL 221.29■■□□□ 13e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-207ENST00000582463 239 ntTSL 521.05■□□□□ 0.963e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.623e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.773e-12■□□□□ 9
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UTP3Q9NQZ2 SNHG4-201ENST00000448190 542 ntTSL 414.42□□□□□ -0.16e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.246e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-202ENST00000505522 629 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.346e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-206ENST00000508735 310 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.346e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-208ENST00000514110 679 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.346e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-207ENST00000513259 444 ntTSL 59.34□□□□□ -0.916e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.63□□□□□ -1.516e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-205ENST00000507692 575 ntTSL 55.35□□□□□ -1.556e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.792e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.58□□□□□ -22e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.299e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.239e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-203ENST00000447624 1013 ntTSL 313.41□□□□□ -0.269e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-206ENST00000622874 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.329e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-205ENST00000491055 2355 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.49e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.32□□□□□ -1.249e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 213.85□□□□□ -0.199e-7■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.31□□□□□ -1.886e-9■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 ACTN4-208ENST00000497637 877 ntTSL 221.11■□□□□ 0.976e-7■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 ACTN4-205ENST00000477174 544 ntTSL 314.29□□□□□ -0.126e-7■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-207ENST00000478153 2082 ntTSL 1 (best)23.69■■□□□ 1.382e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-201ENST00000359681 742 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.632e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-208ENST00000487233 2225 ntTSL 210.63□□□□□ -0.712e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-202ENST00000420712 385 ntTSL 510.11□□□□□ -0.792e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-209ENST00000490649 1701 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.912e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 CBX5-206ENST00000618078 2627 ntTSL 216.52■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-218ENST00000478365 439 ntTSL 28.37□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 510.91□□□□□ -0.663e-9■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 310.88□□□□□ -0.673e-9■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 59.62□□□□□ -0.873e-9■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 SRSF5-213ENST00000556330 546 ntTSL 210.15□□□□□ -0.785e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 HSF4-221ENST00000522459 358 ntTSL 314.8□□□□□ -0.047e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 HSF4-202ENST00000517680 368 ntTSL 313.99□□□□□ -0.177e-6■□□□□ 8.7
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