Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.846e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 AGRN-208ENST00000479707 584 ntTSL 320.26■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-209ENST00000579698 572 ntTSL 420.01■□□□□ 0.799e-8■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.76e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PLXDC1-215ENST00000579190 565 ntTSL 417.7■□□□□ 0.425e-12■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-210ENST00000581271 528 ntTSL 417.6■□□□□ 0.419e-8■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-206ENST00000577624 510 ntTSL 317.57■□□□□ 0.49e-8■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 316.97■□□□□ 0.316e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.034e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 514.22□□□□□ -0.136e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 PYCR1-208ENST00000579366 681 ntTSL 311.78□□□□□ -0.529e-8■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 211.76□□□□□ -0.536e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.756e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 29.52□□□□□ -0.896e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 TIMP1-203ENST00000441738 341 ntTSL 58.84□□□□□ -0.994e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-206ENST00000482860 2599 ntTSL 26.31□□□□□ -1.44e-6■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.78□□□□□ -1.483e-16■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)2.16□□□□□ -2.066e-10■□□□□ 9.6
UTP3Q9NQZ2 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC10.37□□□□□ -0.754e-19■□□□□ 9.5
UTP3Q9NQZ2 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.484e-19■□□□□ 9.5
UTP3Q9NQZ2 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 44.86□□□□□ -1.634e-19■□□□□ 9.5
UTP3Q9NQZ2 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.684e-19■□□□□ 9.5
UTP3Q9NQZ2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-11■□□□□ 9.4
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP426-201ENST00000362901 121 ntBASIC8.76□□□□□ -1.012e-11■□□□□ 9.4
UTP3Q9NQZ2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.01■□□□□ 0.631e-11■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 NDUFV2-208ENST00000577703 854 ntTSL 323.8■■□□□ 1.45e-7■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 NDUFV2-209ENST00000583375 211 ntTSL 517.34■□□□□ 0.375e-7■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 216.86■□□□□ 0.291e-17■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.11e-17■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2BG-201ENST00000541790 1534 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-8■□□□□ 9.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.474e-7■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM165-205ENST00000508404 1657 ntTSL 223.3■■□□□ 1.324e-7■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.314e-7■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM165-209ENST00000514070 433 ntTSL 218.19■□□□□ 0.54e-7■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-211ENST00000498516 655 ntTSL 322.93■■□□□ 1.261e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.191e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.081e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.921e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.531e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 9.2
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -04e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-209ENST00000472057 727 ntTSL 314.88□□□□□ -0.034e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-204ENST00000405198 3838 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.464e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.474e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.474e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.684e-10■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-211ENST00000506298 549 ntTSL 27.78□□□□□ -1.165e-6■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 DDX5-225ENST00000583562 465 ntTSL 1 (best)6.81□□□□□ -1.325e-6■□□□□ 9.1
UTP3Q9NQZ2 RPL36-208ENST00000590786 907 ntTSL 221.29■■□□□ 13e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-207ENST00000582463 239 ntTSL 521.05■□□□□ 0.963e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.623e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.773e-12■□□□□ 9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-203ENST00000506188 801 ntTSL 414.87□□□□□ -0.036e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-201ENST00000448190 542 ntTSL 414.42□□□□□ -0.16e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.246e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-202ENST00000505522 629 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.346e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-206ENST00000508735 310 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.346e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-208ENST00000514110 679 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.346e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-207ENST00000513259 444 ntTSL 59.34□□□□□ -0.916e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.63□□□□□ -1.516e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SNHG4-205ENST00000507692 575 ntTSL 55.35□□□□□ -1.556e-39■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.792e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.58□□□□□ -22e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.299e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.239e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-203ENST00000447624 1013 ntTSL 313.41□□□□□ -0.269e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-206ENST00000622874 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.329e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 MAEL-205ENST00000491055 2355 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.49e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.32□□□□□ -1.249e-7■□□□□ 8.9
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 213.85□□□□□ -0.199e-7■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.31□□□□□ -1.886e-9■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 ACTN4-208ENST00000497637 877 ntTSL 221.11■□□□□ 0.976e-7■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 ACTN4-205ENST00000477174 544 ntTSL 314.29□□□□□ -0.126e-7■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-207ENST00000478153 2082 ntTSL 1 (best)23.69■■□□□ 1.382e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-201ENST00000359681 742 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.632e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-208ENST00000487233 2225 ntTSL 210.63□□□□□ -0.712e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-202ENST00000420712 385 ntTSL 510.11□□□□□ -0.792e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 RPL37A-209ENST00000490649 1701 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.912e-8■□□□□ 8.8
UTP3Q9NQZ2 CBX5-206ENST00000618078 2627 ntTSL 216.52■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-218ENST00000478365 439 ntTSL 28.37□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 510.91□□□□□ -0.663e-9■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 310.88□□□□□ -0.673e-9■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 59.62□□□□□ -0.873e-9■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 SRSF5-213ENST00000556330 546 ntTSL 210.15□□□□□ -0.785e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 HSF4-221ENST00000522459 358 ntTSL 314.8□□□□□ -0.047e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 HSF4-202ENST00000517680 368 ntTSL 313.99□□□□□ -0.177e-6■□□□□ 8.7
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