Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PLG-202ENST00000308192 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TRAPPC2-201ENST00000359680 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ARHGEF9-228ENST00000636926 5436 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZBTB20-202ENST00000393785 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MYF6-201ENST00000228641 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ELP4-218ENST00000639570 5795 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ATP8B5P-202ENST00000423138 2157 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC007038.1-201ENST00000452057 2199 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 EAPP-201ENST00000250454 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CCDC181-201ENST00000367805 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 C1RL-AS1-205ENST00000541775 5272 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ANKEF1-202ENST00000378392 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MYH13-201ENST00000252172 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MYO1H-202ENST00000431443 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CHERP-201ENST00000198939 4084 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TEX10-204ENST00000535814 3006 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CCNB1IP1-204ENST00000398163 1604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 OR7C1-201ENST00000248073 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CPO-201ENST00000272852 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PTGR1-201ENST00000309195 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 APOL4-201ENST00000328429 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FCER1G-202ENST00000367992 551 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PRR13-201ENST00000379786 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ALDOAP2-201ENST00000398050 1076 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RPS27A-203ENST00000404735 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC01241-201ENST00000423326 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HMGN1P38-201ENST00000431116 303 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC012456.2-201ENST00000431500 561 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SNX18P7-201ENST00000454116 635 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL391883.1-201ENST00000454736 447 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RN7SL116P-201ENST00000470786 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC120036.1-201ENST00000479243 654 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 OR7E86P-201ENST00000505858 990 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RACK1-233ENST00000514455 791 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FAM83A-AS1-201ENST00000517519 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 WBP1LP10-201ENST00000519787 364 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC091114.1-201ENST00000522815 630 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC011092.1-201ENST00000533128 1047 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC007552.2-201ENST00000541892 603 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AP003721.3-201ENST00000543275 405 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC007342.2-201ENST00000568878 395 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CIAPIN1-214ENST00000569979 896 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SNX11-206ENST00000580219 1200 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC01255-205ENST00000591318 708 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RN7SL185P-201ENST00000615150 249 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.205-201ENST00000620071 267 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PDE4DIP-249ENST00000620605 823 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC096920.2-201ENST00000624711 339 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SOX2-OT-249ENST00000628810 618 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 OR55B1P-202ENST00000641245 1276 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SGK1-203ENST00000367857 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ACAD10-220ENST00000549590 2888 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GUCY1A3-204ENST00000455639 2631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 BLOC1S2-203ENST00000441611 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PLA2G4E-201ENST00000399518 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CD44-201ENST00000263398 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SLC6A4-203ENST00000401766 6543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FAM162A-203ENST00000477892 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 C11orf57-209ENST00000532163 3739 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZBTB43-202ENST00000373464 5965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MPI-202ENST00000352410 5828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC020558.3-201ENST00000623335 1703 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CARMN-201ENST00000505254 3950 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 KLHL7-AS1-201ENST00000419813 2564 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FGD3-201ENST00000337352 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC008074.3-201ENST00000561559 1907 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL590132.1-201ENST00000639602 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GHRH-201ENST00000237527 461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SNORA5C-201ENST00000364902 137 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 C9orf135-201ENST00000377197 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RNVU1-1-201ENST00000384610 164 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FAM3B-202ENST00000398646 1026 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TMEM139-203ENST00000409244 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 645 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC130710.1-202ENST00000428280 853 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CRYZP1-201ENST00000428923 947 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HTATSF1P1-201ENST00000432008 984 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 NLGN4Y-AS1-201ENST00000434164 532 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC005013.1-201ENST00000436594 588 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL445072.1-201ENST00000438994 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC073321.1-201ENST00000441803 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CTNNA2-214ENST00000496558 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 OR5AC4P-201ENST00000509306 919 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ATP5G1-209ENST00000514808 359 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC004066.2-201ENST00000514879 572 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RNA5SP409-201ENST00000516815 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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