Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 EFHB-201ENST00000295824 2823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SLAMF7-202ENST00000368042 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RAB11FIP1P1-201ENST00000438337 1762 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL021707.2-203ENST00000444381 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC01531-202ENST00000536898 3312 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 STX16-203ENST00000358029 4329 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GRB2-204ENST00000392563 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LRRC7-201ENST00000035383 5000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 IFT122-205ENST00000431818 4414 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MND1-201ENST00000240488 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RPL21-202ENST00000311549 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MEFV-202ENST00000339854 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 BORCS7-202ENST00000369883 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TRBV11-1-201ENST00000390367 364 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TRBV6-5-201ENST00000390368 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL137222.1-201ENST00000407765 1162 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 DSTNP1-201ENST00000419906 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MTND6P11-201ENST00000431890 483 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 KCNH1-IT1-201ENST00000438597 626 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC013474.1-201ENST00000440018 799 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC011452.1-201ENST00000451973 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CHCHD4P3-201ENST00000455954 410 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL033384.2-201ENST00000474641 456 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC139453.1-201ENST00000504027 895 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FAM170A-205ENST00000515256 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AP000797.3-201ENST00000537491 548 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZMYND19P1-201ENST00000554267 787 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ISCA2-202ENST00000554924 489 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RN7SL509P-201ENST00000579670 297 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC239859.4-201ENST00000582255 675 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 OR10J1-202ENST00000641630 1089 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC02078-201ENST00000592718 4237 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 DCAF4L1-201ENST00000333141 4772 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PAFAH2-202ENST00000374284 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CASP12-203ENST00000422698 1685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HCG18-242ENST00000602319 3342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PTPN12-203ENST00000415482 2316 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 OR2Z1-202ENST00000641125 1755 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ETV1-206ENST00000405218 3391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC138907.1-201ENST00000570183 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ZNF596-202ENST00000320552 2696 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PRSS51-204ENST00000637190 2149 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 KLHL18-201ENST00000232766 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ADAM32-201ENST00000379907 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 NOP2-207ENST00000537442 2613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 HIF3A-205ENST00000377670 5852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MID1-211ENST00000610939 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-203ENST00000344100 6634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC026877.1-201ENST00000476047 1411 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 THNSL2-201ENST00000324166 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LRRC6-203ENST00000518642 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 NME9-202ENST00000333911 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RNU1-34P-201ENST00000364421 157 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ASAH2B-201ENST00000374006 632 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 U3.24-201ENST00000391177 215 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 UQCR10-202ENST00000401406 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 ALKAL2-203ENST00000401503 748 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 RNASE1-204ENST00000412779 896 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC010998.1-201ENST00000414774 943 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL360268.2-201ENST00000414976 380 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 COPS5P1-201ENST00000415778 785 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LINC00864-201ENST00000429129 746 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PHKG1P1-201ENST00000442924 614 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 LY86-AS1-203ENST00000447858 938 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AF003529.1-201ENST00000455649 644 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL355497.2-201ENST00000456346 880 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 BAALC-AS1-202ENST00000500902 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC008840.1-201ENST00000512486 809 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC090568.2-201ENST00000523254 497 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 IGLV3-31-201ENST00000523713 297 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC025423.1-201ENST00000544710 374 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TSFM-209ENST00000548851 794 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC064805.1-201ENST00000581412 529 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AC005954.2-201ENST00000586503 556 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TMEM147-AS1-204ENST00000590125 698 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 MAGOH3P-201ENST00000605130 447 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL596092.1-201ENST00000605701 304 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 AL355480.3-201ENST00000630128 96 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 TPM3-210ENST00000368530 1523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 IL6-204ENST00000404625 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 SIDT2-203ENST00000431081 3910 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 UNC45B-201ENST00000268876 5679 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 PKMP5-201ENST00000454707 1601 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 NLGN4X-208ENST00000538097 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LMO3Q8TAP4 FP565260.7-201ENST00000623998 3634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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