Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V9GYV3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
V9GYV3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
V9GYV3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
V9GYV3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms