Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms