Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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SNX13Q9Y5W8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX13Q9Y5W8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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