Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C3Q9Y5Q9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms