Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNPO3Q9Y5L0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNPO3Q9Y5L0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms