Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDP1Q9Y5B0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDP1Q9Y5B0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms