Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFE2L3Q9Y4A8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3Q9Y4A8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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