Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms