Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms