Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4E1Q9UPM8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4E1Q9UPM8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms