Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms