Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARX2Q9UMQ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARX2Q9UMQ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms