Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH9Q9ULB4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH9Q9ULB4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms