Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA11Q9UKX5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms