Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms