Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBE1Q9UJT0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBE1Q9UJT0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms