Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MSRAQ9UJ68 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms