Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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