Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms