Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms