Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF639Q9UID6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF639Q9UID6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF639Q9UID6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF639Q9UID6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF639Q9UID6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF639Q9UID6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNF639Q9UID6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF639Q9UID6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms