Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPS1Q9UHF7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPS1Q9UHF7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPS1Q9UHF7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPS1Q9UHF7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPS1Q9UHF7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPS1Q9UHF7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPS1Q9UHF7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms