Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R1BQ9UD71 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R1BQ9UD71 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R1BQ9UD71 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R1BQ9UD71 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R1BQ9UD71 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R1BQ9UD71 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R1BQ9UD71 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R1BQ9UD71 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms