Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC6Q9UBN7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms