Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUCLA2Q9P2R7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLA2Q9P2R7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms