Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRBP1Q9P2E9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRBP1Q9P2E9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRBP1Q9P2E9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms