Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP2Q9P278 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNIP2Q9P278 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNIP2Q9P278 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNIP2Q9P278 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP2Q9P278 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP2Q9P278 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP2Q9P278 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP2Q9P278 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP2Q9P278 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP2Q9P278 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms