Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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