Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP1Q9NZU7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms