Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD2Q9NZR1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD2Q9NZR1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD2Q9NZR1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms