Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
BICRAQ9NZM4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
BICRAQ9NZM4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
BICRAQ9NZM4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
BICRAQ9NZM4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
BICRAQ9NZM4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
BICRAQ9NZM4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
BICRAQ9NZM4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
BICRAQ9NZM4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BICRAQ9NZM4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
BICRAQ9NZM4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
BICRAQ9NZM4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms