Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKIRAS1Q9NYS0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms